深圳港口有：蛇口碼頭、福永碼頭、鹽田碼頭、赤灣碼頭、媽灣碼頭。

1、蛇口碼頭

蛇口客運碼頭，始建于1981年。2016年10月30日蛇口客運碼頭正式停運。結(jié)束了35年的客運服務(wù)。蛇口客運碼頭業(yè)務(wù)搬至蛇口郵輪中心。10月31日，蛇口郵輪中心正式開門營業(yè)，市民可在此坐船前往香港、澳門和珠海。

2、福永碼頭

深圳機場碼頭（舊稱：福永碼頭/深圳機場福永碼頭），英文名：ShenzhenAirportFerryTerminal，位于深圳寶安國際機場西南位置，距機場T3航站樓僅2公里。

3、鹽田碼頭

鹽田港（YantianPort），是中國廣東省深圳市港口，位于深圳市南大鵬灣北岸，西臨沙頭角，西北經(jīng)24千米鐵路達深圳市，東至惠州72千米，南為小梅沙。

4、赤灣碼頭

赤灣港在深圳經(jīng)濟特區(qū)西部的南頭半島頂端，位于珠江口東岸，距香港在20海里。距珠海、澳門在50海里，水、陸路距廣州約150公里。

5、媽灣碼頭

深圳媽灣港區(qū)該港區(qū)內(nèi)主要有海星港口發(fā)展有限、深圳樂意液體倉庫倉儲有限公司、深圳月亮灣油料港務(wù)有限公司、南油港口倉儲發(fā)展有限公司、深圳市滬星拖輪有限公司、深圳市能源港務(wù)有限公司等，其主要經(jīng)營散雜貨、液體化工產(chǎn)品、油品和煤炭等。

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